Біологічний факультет

Харківський національний університет імені В.Н.Каразіна V.N.Karazin Kharkiv National University

Головна сторінка

Про факультет

Кафедри

Міжнародне співробітництво

Працевлаштування випускників

Біоінформатика


Колекції баз даних та інструментів			Навчання он-лайн
Колекція баз даних NAR The Bioinformatics Links Directory Колекція ресурсів NCBI Глобальний пошук NCBI Колекція сервісів EMBL-EBI Колекція сервісів ExPASy Енциклопедія KEGG SoftBerry Resources HSLS Online Bioinformatics Resource Collection HarvesterPortal			NCBI-Training & Tutorials NCBI-educational resources NCBI-how to use NCBI-YouTube video EMBL-EBI Training Ensembl Tutorials UCSC-traning PDB-educational resources PDB-screencasts
Шляхи обміну речовин та сигналінгу
			Енциклопедія KEGG Reactome PANTHER NetPath Brenda Enzymes Cofactors MENTHA - Molecular Interactions IMID - Integrated Molecular Interaction Database String-Protein Interactions DIP - Protein Interactions
Геноміка та протеоміка
Геномні браузери		Ensembl (E!) UCSC H-inv
Бази даних		NCBI Gene UniProt DB HGNC GeneCards
Вирівнювання послідовностей та філогенетика
			BLAST NCBI BLAST/BLAT Ensembl BLAT-UCSC	Пошук гомологів та парне вирівнювання
			Cobalt-NCBI Clustal-omega T-Coffee collection MUSCLE Phylogeny collection	Множинне вирівнювання та філогенетика
Структурна біоінформатика
Бази даних: структура білків і функціональні сайти		Protein Data Bank (PDB) Pfam Protein Information Resource PROSITE SIB Resources CATH Gene3D
Передбачення 3D структури та докінг		Swiss-PDB-Viewer CSA-structural alignment I-Tasser Robetta Expasy-collection Bioinformatics Toolkit
Аналіз генної онтології			Дослідження мікроРНК
	AmiGO QuickGO DAVID GeneCodis GOEAST Webgestalt	>> Функціональний аналіз генів з екзонізованою ALU послідовністю/ Доповідь-презентація Т.В.Бараннік на 10-му біохімічному з'їзді, 2010, Одеса	miRBase DianaLab miRWalk miRecords miRror Targetscan-human miROrtho mimiRNA miR-ontology	>> Дослідження мікроРНК / Доповідь-презентація Т.В.Бараннік на 1-му з'їзді з Медичної та біологічної інформатики, 2010, Київ
Світові центри біоінформатики			Міжнародні проекти
International Nucleotide Sequence Database Collaboration The National Center for Biotechnology Information (NCBI) European Bioinformatic Institute (EMBL-EBI) Kyoto University BGI (China) Wellcome Trust Sanger Institute (UK)			1000genomes Human Proteomic Initiative Human Metabolome Project Cancer genome project European Commission -omics initiatives On-line Research Resources

Доповіді на ХІ Українському біохімічному конгресі у Києві, жовтень 2014 р.: >> стендова доповідь студентки біологічного факультету Сапожникової Валерії (БХ-41) >> Усна доповідь доц.Бараннік Т.В. .			>> PERSPECTIVES OF DATABASES AND PROGRAM TOOLS DEVELOPMENT IN BIOINFORMATICS / Пленарна доповідь Бараннік Т.В. на Міжнародній конференції:, TAAPSD'2010, Kiev

------------------

До уваги студентів 3-го та 5-го курсів!
У зв'язку з оголошенням карантину, заняття з біоінформатики та системної біології перешли у дистанційний формат.
Ваші звіти з результатами практичних завдань треба надсилати через відповідні
дистанційні курси !
Дистанційний курс - це офіційний засіб для отримання завдань та оцінок, крім того вони містять багато інформації: лекції, додаткові методичні вказівки до практичних та індивідуальних завдань. Перевірте будь ласка свій доступ до дистанц.курсу!
Якщо у вас досі не відкривається курс, напишіть>

------------------

Курс "Біоінформатика"
Як надіслати звіт через дистанц.курс
(інструкція) >>

------------------

Курс "Системна біологія"
Як надіслати звіт через дистанц.курс
(інструкція) >>

------------------
Презентація з біоінформатики >>

------------------

Запрошуємо
студентів 1-2 курсу на науковий гурток
з біоінформатики !
Заняття проходять
на кафедрі біохімії
(ауд.ІІ-5)

Електронна адреса відповідального за сайт факультету : tbarannik[at]karazin.ua