Харківський національний університет імені В.Н.Каразіна                                                 V.N.Karazin Kharkiv National University

 

 Головна сторінка

 Про факультет

 Кафедри

 Абітурієнту

 Бази практики

 Навчальний процес

 Наукова робота

 Студентське життя

 Інтернет-біоресурси

 Новини

 

Біоінформатика

   

Колекції баз даних та інструментів

 
Навчання он-лайн
 
Колекція баз даних NAR
The Bioinformatics Links Directory
Колекція ресурсів NCBI
Глобальний пошук NCBI
Колекція сервісів EMBL-EBI
Колекція сервісів ExPASy
Енциклопедія KEGG
SoftBerry Resources
HSLS Online Bioinformatics Resource Collection
HarvesterPortal
 

UCSC-traning
PDB-educational resources
PDB-screencasts

Шляхи обміну речовин та сигналінгу

 

Енциклопедія KEGG
Reactome
PANTHER
NetPath

Brenda
Enzymes
Cofactors

MENTHA - Molecular Interactions
IMID - Integrated Molecular Interaction Database
String-Protein Interactions
DIP - Protein Interactions

Геноміка та протеоміка

Геномні браузери

Ensembl (E!)
UCSC
H-inv

 

Бази даних
NCBI Gene
UniProt DB
HGNC
GeneCards
Вирівнювання послідовностей та філогенетика

 
Пошук гомологів та парне вирівнювання

Cobalt-NCBI
Clustal-omega
T-Coffee collection
MUSCLE

Phylogeny collection

Множинне вирівнювання та
філогенетика
Структурна біоінформатика

Бази даних:
структура білків і
функціональні сайти

Protein Data Bank (PDB)
Pfam
Protein Information Resource
PROSITE
SIB Resources
CATH
Gene3D
 
Передбачення
3D структури
та докінг
Swiss-PDB-Viewer
CSA-structural alignment
I-Tasser
Robetta
Expasy-collection
Bioinformatics Toolkit
Аналіз генної онтології
 
Дослідження мікроРНК

AmiGO
QuickGO

DAVID
GeneCodis
GOEAST
Webgestalt

>> Функціональний аналіз генів з
екзонізованою ALU послідовністю/
Доповідь-презентація Т.В.Бараннік
на 10-му біохімічному з'їзді, 2010, Одеса
  >> Дослідження мікроРНК /
Доповідь-презентація Т.В.Бараннік на 1-му з'їзді з Медичної та біологічної інформатики, 2010, Київ
Світові центри біоінформатики
 
Міжнародні проекти
International Nucleotide Sequence Database Collaboration
The National Center for Biotechnology Information (NCBI)
European Bioinformatic Institute (EMBL-EBI)
Kyoto University
BGI (China)
Wellcome Trust Sanger Institute (UK)
  1000genomes
Human Proteomic Initiative
Human Metabolome Project
Cancer genome project
European Commission -omics initiatives
On-line Research Resources
     
 

 

Презентація з біоінформатики >>

------------------

Біоінформатика для
4 курсу (спец. Біологія)

>>План занять

>>Практ.1

>>Практ.2

>>Практ.3

>>Практ.4

>>Практ.5

>>Практ.6

----

>>Лекція 7-1

>>Лекція 7-2

>>Лекція 7-3

------------------

>>Д/З -1
Pubmed


>для Д/З-1

>>Д/З -2
Мотиви

>>Д/З -3
Мережі

>>Д/З -4
Ген білку

>білки для Д/З-4

>>Д/З -5
База знань

>>Контрольні питання

-------------------------

Системна Біологія

>>Огляд ресурсів біоінформатики

>>Індивідуальні завдання

>>Практ-5

список 5-1

список 5-2

список 5-3

список 5-4

GDS4938

>>Практ-6

>>Практ-7

BIOMD0000000007.m

BIOMD0000000107.m

bier.dat

>>Практ-8

>fasta-АК

>fasta-ДНК

>>Практ-9

>>Практ-10

>>Практ-11

>>Практ-12

---------

Запрошуємо
студентів 1-2 курсу на науковий гурток
з біоінформатики
!
Заняття проходять
на кафедрі біохімії
(ауд.ІІ-9, ІІ-5)

Завдання №4>>

>>Файл для вирівнювання

Завдання №3>>

Приклад
завдання №3>>

Завдання №2>>

Приклад
завдання №2>>

Завдання №1>>

Таблиця для
завдання №1>>

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Електронна адреса відповідального за сайт факультету : tbarannik[at]karazin.ua